作者:田婵, 李云燕, 乔欢, 张毓, 陈慰峰
【摘要】 目的: 制备兔抗人转录因子TFDP3、 TFDP1的多克隆抗体, 并鉴定其反应性及特异性。方法: 选择TFDP3和TFDP1差异较大肽段, 利用人工合成多肽免疫家兔, 采用真核表达载体瞬时转染HEK293细胞表达TFDP3和TFDP1真核蛋白, 通过Western blot分析抗体的反应性和特异性。结果: 通过氨基酸序列比对选择TFDP3 1726, TFDP1 1732氨基酸残基合成多肽, 制备了兔抗人TFDP3、 TFDP1多肽抗体, Western blot检测显示, 抗TFDP3抗体可以特异性识别TFDP3, 而抗TFDP1抗体既可识别TFDP1又可与TFDP3结合。结论: 制备了兔抗人TFD31和TFDP1的多肽抗体, 且TFDP3抗体与TFDP1无交叉反应。
【关键词】 TFDP3; TFDP1; 多肽抗体
人转录因子(transcriptional factor, TF)DP3最初是通过重组cDNA表达文库的血清学分析法(serological analysis of recombinant cDNA expression library, SEREX)从人肝癌组织中筛选出的新肿瘤睾丸(cancertestis, CT)抗原, 即HCA661[1]。TFDP3全长405个氨基酸, 位于人染色体Xq26.2。随着研究的深入, 发现其还是人转录因子DP家族成员[2], 故由此命名TFDP3。目前已知人DP家族包括TFDP1和TFDP2, 其生物学功能主要是与转录因子E2F16结合形成异源二聚体, 大大增加E2F结合DNA的能力, 从而激活其下游靶基因的转录。不同的E2F/DP二聚体激活不同基因的转录, 主要取决于E2F, 其效应涉及DNA合成、 复制, 细胞周期进展, 细胞凋亡, DNA损伤及修复等。其中E2F13/DP可促进细胞从G1期进入S期, 并促进细胞增殖[3]。而E2F1/DP可以在血清饥饿或射线照射后诱导细胞凋亡[4]。TFDP3作为DP家族新成员, 与已知DP功能相左, 虽然可以和E2F16结合形成二聚体, 但是并不能提高E2F结合DNA的能力, 从而抑制了E2F转录激活活性, 并因此抑制了E2F诱导的细胞周期进程和细胞增殖。此外, TFDP3还能抑制E2F1介导的血清饥饿和γ射线引起的细胞凋亡, 且该作用可能通过p53通路起作用[5], 对E2F生物学活性起到重要的调节作用。由于TFDP3与TFDP1全长只相差5个氨基酸, 且氨基酸序列相似性达到82%, 所以, 为鉴别两种蛋白, 深入研究TFDP3, 我们制备了TFDP3和TFDP1多肽抗体, 并对其特异性进行了鉴定。
1 材料和方法
1.1 材料 人胚肾细胞系HEK293由本实验室冻存; 家兔(雄性, 体质量≥2.5 kg的大耳白品系)由北京大学医学部动物部提供并饲养。TRIzol试剂购自GibcoBRL公司, RTPCR试剂盒由Clontech(Clontech. Palo Alto, CA)公司提供, 免疫用多肽由杭州中肽生化有限公司合成。抗FLAG小鼠单克隆抗体(mAb)M2购自Sigma公司, 碱性磷酸酶(AP)标记的抗小鼠和抗兔的二抗由Promega公司提供, 显色剂NBT/BCIP系Boehringer mannlteim公司产品。
1.2 方法
1.2.1 多肽的选择 通过NCBI网站将TFDP1与TFDP3的蛋白序列进行比对(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/bl2seq/wblast2.cgi), 寻找二者有连续差异的肽段。
1.2.2 多肽抗体制备 将所选多肽与铜蓝蛋白耦联后, 与福氏佐剂等量混合作为抗原, 多点皮下注射免疫家兔, 并分别于初次免疫后的第21、 42、 70天加强免疫。其中前2次抗原量为300 μg/只, 后两次抗原量为150 μg/只。为防止因为遗传背景或健康状况等原因导致的抗体差异, 每种抗原免疫两只不同的家兔, 以获得最佳的抗体。经Western blot检测后, 产生抗体的家兔经颈动脉插管放血处死, 分离血清获得抗体。
1.2.3 多肽抗体反应性及特异性检测 免疫前和末次免疫后7 d取家兔耳缘静脉血2 mL, 分离血清后通过Western blot实验鉴定是否产生相应抗体。以真核表达的TFDP1和TFDP3蛋白进行SDSPAGE电泳, 相应多肽免疫所得的兔血清1∶200稀释作为一抗进行杂交, 阳性对照一抗采用抗FALG mAb M2。为检测抗体特异性, 还将抗体与蛋白进行交叉反应, 其他步骤见
参考文献
[5]。处死家兔后所得血清重复上述实验。1.2.4 TFDP3和TFDP1 mRNA的制备及RTPCR检测 HEK293细胞以50 000/cm2的密度铺于直径100 mm细胞培养盘, 以含有100 mL/L新生小牛血清(NCS)的DMEM培养基培养, 24 h后采用磷酸钙沉淀法分别转染10 μg表达蛋白全长的pcDNA3TFDP3flag, pcDNA3TFDP1flag质粒[2], 转染后48 h用TRIzol试剂提取总RNA, 采用RTPCR方法检测TFDP3、 TFDP1在mRNA水平上的表达, 所用引物分别为: TFDP3前向: 5′TAC ACT CGG CCT GGA AGA ATT G3′, 反向: 5′TCT TCC TCC TCG ACT GCT G3′; 反应条件: 94℃ 30 s, 60℃ 30 s, 72℃ 90 s, 35个循环, 72℃延伸10 min; 所得条带: 1 244 bp; TFDP1前向: 5′ATG GCA AAA GAT GCC GGT CTA ATT G3′, 反向: 5′TCG TCC TCG TCA TTC TCG TTG3′; 反应条件: 94℃ 30 s; 55℃ 30 s; 72℃ 90 s, 35个循环, 72℃延伸10 min, 所得条带1 229 bp。阳性对照采用相应质粒为模板, 阴性对照以水为模板。
1.2.5 TFDP3和TFDP1蛋白的制备及Western blot检测 在提取转染HEK293细胞RNA的同时, 还提取了细胞总蛋白, 采用Western blot方法检测两个分子蛋白水平上的表达, 抗FALG mAb M2作为阳性对照, 阴性对照不加一抗, 实验方法如文献[5]所述。
2 结果
2.1 多肽的选择和合成 TFDP3和TFDP1在氨基酸水平上有75.2%的一致性, 通过蛋白序列比对(图1), 发现两者不一致的氨基酸残基大多散在分布, 只有始于17位氨基酸的肽段LMDENQTSRP(TFDP3)和FIDQNLSPGKGVVSL(TFDP1)差异明显, 故选择此两段多肽作为抗原进行免疫, 并分别标注为L和F, 其免疫的不同家兔分别命名为L1、 L2、 F1和F2。
2.2 真核TFDP1、 TFDP3蛋白表达鉴定 HEK293细胞不表达内源性TFDP3, 故将pcDNA3TFDP3flag质粒转染后, 提取瞬时表达的真核蛋白, 鉴定抗体的反应性, 同法得到TFDP1蛋白。首先在转染后48h提取细胞的总RNA, 用RTPCR方法检测了TFDP1和TFDP3在转录水平上的表达(图2A), 在1 200 bp左右与阳性对照一致的位置出现了扩增条带, 说明两个表达载体都进行了转录。随后采用Western blot方法检测了两种蛋白的表达(图2B), 在相对分子质量(Mr)约45 000的位置都出现了条带, 即外源瞬时表达的TFDP1和TFDP3蛋白。
2.3 多肽抗体反应性和特异性鉴定 采用Western blot方法检测抗体的反应性。图3所示, 注射TFDP1来源的F肽段所用家兔F1、 F2血清在免疫前无特异性条带, 而免疫后在与阳性对照相同的位置出现明显条带, 说明该肽段免疫家兔成功产生了抗TFDP1的抗体。同样, 注射TFDP3来源的L肽段的家兔L1、 L2, 其血清在免疫前也无明显条带, 而免疫后在特定位置出现条带。该结果显示L肽段也成功免疫家兔, 产生了可识别TFDP3的抗体, 但L2家兔血清反应后条带不明显, 说明产生抗体的浓度较低。当用L1、 L2兔血清与TFDP1蛋白反应, 未见任何条带, 说明抗TFDP3的抗体只能识别TFDP3蛋白, 而不能识别TFDP1。同法检测TFDP1抗体与TFDP3蛋白的交叉反应, 可见在与阳性对照一致的位置上出现条带, 说明抗TFDP1的多肽抗体既可以识别TFDP1, 又可与TFDP3反应。
3 讨论
TFDP3作为转录因子的研究已经逐渐深入, 但是其作为CT抗原, 除了已知在肝癌组织mRNA中有29.4%的表达率, 10例黑色素瘤组织有2例mRNA阳性外[1], 其在癌组织中的蛋白表达及其病理学意义还不清楚。为深入研究TFDP3在肝癌、 黑色素瘤中表达的意义, 特异性识别TFDP3的抗体是必需的。TFDP1全长410个氨基酸, 比TFDP3多5个, 两者氨基酸一致性达到75.2%, 且有差异的氨基酸散在分布, 蛋白全长免疫动物所得抗体极易造成抗体的交叉反应。目前已有市售的TFDP3商品化单克隆及多克隆抗体, 但是其并未提供相关实验结果证明该抗体不识别TFDP1。故本研究从两个分子相对应的位置选取差异性较大的肽段免疫家兔, 得到特异性识别TFDP3的多肽抗体, 为今后深入研究其功能提供了有效工具。
来源于TFDP1的多肽F产生的抗体与TFDP3存在交叉反应, 可能的原因是, 其肽段中有三段连续的氨基酸残基IDQ、 QNL、 VSL存在于TFDP3的蛋白序列中, 对应于5355、 198200、 57位氨基酸残基。这些氨基酸的极性及酸碱性都有所不同, 分别是IDQ: 非极性-酸性-极性; QNL: 极性-极性-非极性; VSL: 非极性-极性-非极性。一般认为在蛋白质的二级、 三级结构中, 亲水性──极性氨基酸残基位于表面, 而输水性, 即非极性氨基酸包埋于蛋白的内部。蛋白质或多肽的极性、 非极性氨基酸的数量、 比例与抗原位点密切相关, 尤其是亲水性氨基酸出现在抗原表位中的几率更大。TFDP3中这三段不同位置的短肽都包含至少一个极性氨基酸, 所以它们很有可能在空间上形成与F肽段相似的结构表型, 从而与抗F多肽的抗体产生交叉反应。
虽然来源于TFDP3的多肽L也存在3个连续的氨基酸残基SRP与TFDP1蛋白248250位氨基酸一致, 但是实验结果显示抗L多肽的抗体并不识别TFDP1。可能由于L多肽只有这3个连续的氨基酸残基与TFDP1一致, 且其中只有一个极性氨基酸(SRP: 极性-碱性-非极性), 不足以形成一个独特的抗原表位, 所以L多肽免疫家兔产生的抗体特异性较高, 只能识别TFDP3, 而不能与TFDP1反应。
综上, 我们得到了可以特异性识别TFDP3的多肽抗体, 可应用于免疫组化、 免疫荧光、 ELISA及Western blot等实验鉴定癌组织和细胞系内源表达的TFDP3蛋白。
参考文献
[1] Wang Y, Han KJ, Pang XW, et al. Large scale identification of human hepatocellular carcinomaassociated antigens by autoantibodies[J]. J Immunol, 2002, 169(2): 1102-1109.
[2] Qiao H, Di Stefano L, Tian C, et al. Human TFDP3, a novel DP protein, inhibits DNA binding and transactivation by E2F[J]. J Biol Chem, 2007, 282(1): 454-466.
[3] DeGregori J, Johnson DG. Distinct and overlapping roles for E2F family members in transcription, proliferation and apoptosis[J]. Curr Mol Med, 2006, 6(7): 739-748.
[4] Kowalik TF, DeGregori J, Schwarz JK, et al. E2F1 overexpression in quiescent fibroblasts leads to induction of cellular DNA synthesis and apoptosis[J]. J Virol, 1995, 69(4): 2491-2500.
[5] Tian C, Lv D, Qiao H, et al. TFDP3 inhibits E2F1induced, p53mediated apoptosis[J]. Biochem Biophys Res Commun, 2007, 361(1): 20-25.