RAI16蛋白合成肽多克隆抗体的制备及初步应用

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论文字数:**** 论文编号:lw2023122935 日期:2025-12-04 来源:论文网

     作者:雒喜忠, 王阁, 许文, 李琼, 陈川, 张志敏, 胡庆, 王东

【摘要】 目的: 制备RAI16蛋白的合成肽多克隆抗体, 并进行初步鉴定和应用, 为研究RAI16蛋白的功能及作用机制获得重要的实验工具。方法: 应用Fmoc法化学合成RAI16蛋白N端第44~55位氨基酸的多肽, 经C18的RPHPLC纯化后, 通过高碘酸钠法将纯化的RAI16蛋白的多肽与KLH交联; 皮下注射抗原免疫新西兰纯种大耳白兔, 加强免疫得到抗血清, 应用蛋白G纯化获得多克隆抗体。对纯化的抗体进行ELISA、 免疫组化、 Western blot等初步鉴定和应用。结果: 化学合成RAI16蛋白N端第44~55位氨基酸的多肽, 纯化后多肽纯度为96% , 达到免疫用抗原标准。多肽与KLH交联, 用于免疫动物。经纯化后的抗体效价为1∶125 000。该多肽抗体可特异识别人脾脏组织中相对分子质量(Mr)约为55 000的RAI16蛋白。结论: 所制备的多克隆抗体能与天然RAI16蛋白发生特异性反应, 可应用于ELISA、 免疫组化、 免疫沉淀和Western blot等实验, 为确定RAI16蛋白的组织分布和亚细胞定位、 研究RAI16蛋白的功能及作用机制提供了重要的实验工具。

【关键词】 视黄酸诱导蛋白16; 多肽抗原; 多克隆抗体; ELISA; 亲和层析


  近几年在对视黄酸(RA)作用研究中发现了视黄酸诱导蛋白(RAI)系列基因, 但尚无具体完整的结构和功能研究的相关报道, 只是推测RAI 系列蛋白可能是一种“新型”的胞内参与信号转导转录调控的蛋白质家族。视黄酸诱导蛋白16(RAI16)蛋白作为家族成员之一, 了解其结构功能, 对认识整个家族特征具有重要的意义。

  我们前期工作以Tec激酶结构域作为“钓饵”蛋白, 利用酵母双杂交技术筛选构建于转录激活结构域(AD)载体的人胎肝cDNA文库, 经营养缺陷选择及诱导筛选及初步鉴定, 发现并确证了一个新的阳性克隆, 对筛库所得基因片段测序经BLAST比对分析后, 确定为RAI16(Homo sapiens retinoic acid induced 16)基因, 已被GenBank收录(编号为BC052237), 组织来源为脑Ⅳ型星状细胞瘤, 其编码蛋白为RAI16。并由此推译出其蛋白质一级结构, 对其功能区、 信号肽、 亚细胞定位、 二级结构及亲疏水性等进行了分析。研究表明, RAI16蛋白是一种定位于胞质内内质网上的分泌型的球形信号蛋白, RAI16蛋白很可能在肝干细胞和肝癌诱导分化过程中, 作为RA诱导蛋白被信号蛋白分子募集至胞质内, 通过磷酸化、 去磷酸化、 豆蔻酰化、 酰胺化等修饰, 通过不同的活化形式和剪切方式以及胞质与胞核间的移位, 完成其在信号转导中的重要角色[1]。因此推测RAI16蛋白可能为RA信号通路中一类胞质内重要“新”的信号蛋白分子。结合前期工作, 根据人RAI16蛋白的cDNA 编码的氨基酸序列, 结合计算机分子模拟设计11个氨基酸多肽, 经与载体蛋白KLH 偶联作为免疫原, 免疫家兔制备多克隆抗体, 并经亲和层析进行纯化。从而制备出可与天然RAI16蛋白发生特异性结合反应的抗RAI16蛋白的合成肽多克隆抗体, 为进一步深入研究RAI16蛋白的功能、 阐明RAI16在肝癌细胞诱导分化信号转导通路中的作用和明确RAI16与Tec蛋白之间的相互作用机制作奠定了基础。

  1 材料和方法

  1.1 材料 免疫和筛选用的RAI16蛋白cDNA编码的氨基酸序列N端第44~55位氨基酸的多肽为化学合成, 免疫用抗原C端交联载体蛋白钥孔戚血蓝素(KLH), 均由上海艾比玛特公司采用合成肽自动合成仪合成。Methylated bovine serum albumin(MBS)和福氏佐剂为Sigma公司产品。HiTrapTM Protein G HP抗体纯化柱为Amersham公司产品。羊抗兔IgGHRP和 DAB为北京中杉金桥生物技术公司产品。ECL反应试剂盒为Amersham公司产品。SephadexTMG25 脱盐柱(Amersham Biosciences, Sweden)、 小牛血清、 牛血清白蛋白、 loading buffer为TaKaRa宝生物工程(大连)有限公司产品; 免疫用兔子系新西兰纯种白兔2只(1.5个月左右, 雄性健壮, 质量为2 000~ 2 200 g), 由上海申旺实验动物中心提供。

  1.2 方法

  1.2.1 RAI16合成肽的设计 结合前期的研究, 从GenBank中检索到RAI16蛋白cDNA全长序列, 利用DNAstar软件根据抗原指数(Antigenic Index)、 亲水性结构(Hydrophilicity Plot)、 柔韧区(Flexible Regions)及表面概率结构(Surface Probability Plot) 4个参数及特异性、 合成难易程度等方面综合分析RAI16序列的特点, 确定氨基酸片段为欲合成的肽序列, 从N端起包含第44~55位氨基酸, 其序列为: CSTPAKKTDIPWRNh3。

  1.2.2 RAI16蛋白N端多肽抗原的合成及其与KLH 和BSA 的交联 RAI16合成肽由上海艾比玛特公司采用合成肽自动合成仪合成。化学合成采用Fmoc方法, 从C端向N端合成, 获得的多肽经常规C18的RPHPLC柱进行纯化。纯度为96%。RAI16与KLH和BSA的交联采用戊二醛连接法, 将5 mg合成肽加入7 mg KLH和BSA中, 边振荡边缓慢加入新鲜配制的3 g/L 的戊二醛溶液 (1 mL), 室温作用2 h。以pH8.5硼酸缓冲液透析过夜, 交联形成RAI16KLH、 RAI16BSA偶联物。

  1.2.3 RAI16蛋白合成肽抗体的制备 取200 μg合成肽KLH偶联物与等量的完全福氏佐剂充分乳化后, 于兔颈部和背部皮下多点注射, 每点约100 μg。4周后加强免疫, 剂量同前, 用不完全福氏佐剂充分乳化后, 于兔背部皮下多点注射; 以后隔2周加强免疫1次; 从第3次加强免疫开始, 每次免疫后7 d, 经耳中央动脉采血测定抗体的效价, 经过4次加强免疫后符合要求时, 立即颈动脉采血, 分离血清后, 无菌分装保存于-80℃备用。

  1.2.4 ELISA检测抗血清效价 用人脾脏微粒体蛋白和合成肽BSA偶联物以1 mg/L 的浓度包被ELISA检测板, 每孔100 μL, 4℃孵育过夜后, 用10 mL/L胎牛血清封闭, 37℃ 2 h后, 洗涤备用。取出包被好的检测板, 每孔加入按1∶2梯度稀释的抗血清100 μL (对照为正常兔血清), 37℃孵育30 min, 洗涤3次后每孔加入1∶5 000稀释的HRP标记的羊抗兔IgG 100 μL, 37℃孵育30 min, 洗涤3次后进行TMB显色, 37℃孵育15 min, 中止反应后, 用酶标仪测定样品的A450的吸光值。

  1.2.5 抗体血清的亲和纯化 将获得的兔抗人RAI16多肽的抗体血清用结合缓冲液(100 mmol/L Tris/HC1, pH7.5, 100 mmol/L NaC1)稀释后, 经0.45 μm的滤膜过滤, 加样到HiTrapTM ProteinG HP的纯化柱上, 用洗脱缓冲液(100 mmol/L甘氨酸HCL, ph3.5)洗脱后, 收集洗脱峰。

  1.2.6 间接ELISA检测抗体相对亲和常数 用合成肽交联BSA以1.5 mg/L和1.0 mg/L的浓度包被ELISA检测板, 封闭后加入倍比稀释的已知蛋白浓度的纯化后的抗体, 再加入HRP标记的羊抗兔IgG二抗, TMB显色测定A450。以抗体浓度的对数为横坐标, A450值为纵坐标作图。以曲线达到水平时的A值为100%, 求出A50即50% A值对应的抗体浓度。按照Kaff=(n-1)/2(n[Ab’] t - 2 [Ab ] t) 算出抗体亲和常数, 其中[Ab’] t 、 [Ab ] t指的是A50时即包被抗原为1.5 mg/L和1.0 mg/L时抗体半饱和时抗体的摩尔浓度, [Ag] t、 [Ag’] t指的是包被的抗原浓度本实验中即指15 μg和10 μg, n=[Ag]t/[Ag’]t, 本实验中n=2。

  1.2.7 多克隆抗体的Western blot分析 用RIPA裂解液(10 mL/L NP40, 150 mmol/L NaCl, PBS pH7.2, 2 mmol/L EDTA, 50 mmol/L氟化钠, 0.2 mmol/L矾酸钠, 蛋白酶抑制剂1∶50)裂解冰冻人脾脏组织样品, 冰上孵育30 min后, 13 500 g离心45 min, 获得脾脏组织总蛋白, 取5 g总蛋白裂解液并加入等体积2×SDS加样缓冲液, 于100℃加热5 min后, 进行常规SDSPAGE电泳, 分离胶浓度为100 g/L。电泳结束后, 电转至PVDF膜上, 用50 g/L脱脂奶粉室温下封闭1 h; 然后加入1∶1 000稀释的兔抗人RAI16蛋白N端多肽多抗, 室温下孵育2 h, TBST缓冲液洗膜后, 加入羊抗兔IgGHRP抗体(1∶5 000稀释), 室温下孵育1 h, TBST缓冲液洗膜后, ECL法显色。

  1.2.8 RAI16在再生肝组织中表达的Western blot分析 组织蛋白提取按申能博彩RIPA使用说明书操作(同时增加5 mmol/L benzamidine, 1 μmol/L aprotinin A, 1 μmol/L pepstatin, 1 μmol/L leupeptin, 1 mmol/L PMSF, pH7.4), 上清进行冷冻干燥24 h, 用含蛋白酶抑制剂的PBS 60 μL稀释蛋白沉淀; 对获得肝组织蛋白进行考马斯亮蓝法定量, 调整密度为6 g/L, 样品容积与载样缓冲液等量混合, 实际浓度为3 g/L。样品15 μL/lane, 100℃, 煮沸5 min、 迅速冷却, 短暂离心; 生物素标记Marker , 10 μL+10 μL载样缓冲液/lane , 100℃, 煮沸2 min、 迅速冷却, 短暂离心。按生物素标记Marker、 正常对照组、 肝切除术后0.5 h、 1 h、 2 h、 4 h、 8 h、 24 h、 48 h、 72 h的顺序加样后, 进行常规SDSPAGE电泳, 分离胶浓度为110 g/L。电泳结束后, 电转至PVDF膜上, PVDF膜经标记、 PBS洗后入60 g/L nonfat milk的pH7.2的PBS中封闭, 室温1~2 h, 置 4℃冰箱过夜; 然后加入1∶300稀释的兔抗人RAI16多克隆抗体, 同时加入小鼠抗βactin mAb 7.5 μL, 使体积比为1∶2 000, 室温下孵育1 h; PBS缓冲液洗膜后, 加入抗兔HRPIgG、 抗鼠HRPIgG, 工作浓度均为1∶2 500, 抗生物素HRP抗体30 μL, 工作浓度为1∶1 000, 室温孵育1 h, PBS缓冲液洗膜后, ECL法显色, 背景洗涤, 再定影。

  1.2.9 多克隆抗体的免疫组化染色 取出用丙酮固定的石蜡包埋的大鼠再生脏组织切片, 滴加50 g/L BSA, 室温下封闭20 min, 加入1∶1 000稀释RAI16多肽抗体, 4℃孵育过夜。PBS洗片后加入羊抗兔IgG2HRP, 37℃孵育20 min, PBS洗片后进行DAB显色, 苏木素复染, 返蓝后, 脱水、 透明、 封片, 镜检, 放大400倍拍照记录结果。

  2 结果

  2.1 RAI16的氨基酸序列分析 用DNAstar软件根据亲水性结构、 柔韧区、 抗原指数及表面概率结构4个参数对氨基酸序列进行综合分析(图1) 。预测的结果进行综合考虑, 选取欲合成的肽序列为第44~55位氨基酸(图中阴影区), 其序列为: CSTPAKKTDIPWRNh3。

  2.2 RAI16蛋白多肽抗原的合成与纯化 化学合成的多肽经HPLC纯化后, 纯度可达96%, 交联KLH后可作为抗原免疫动物。

  2.3 抗血清的特性鉴定 ①效价测定: 合成多肽经4次动物免疫并进行效价测定确定抗体产生后, 收集兔抗血清, 蛋白G纯化后, 经间接ELISA检测, 效价约为1∶125 000。②相对亲和力常数测定(图2): 用间接ELISA测定纯化后抗体的亲和常数10-5~10-6 M-1。

  2.4 RAI16合成肽多克隆抗体的Western blot分析 由于RAI16在脾脏组织表达丰度较肝组织显著, 因此选取脾脏组织并将其裂解后获取的总蛋白作为电泳样本, 对纯化的兔抗人RAI16合成肽多克隆抗体进行Western blot分析, 结果发现RAI16合成肽的多克隆抗体可特异性识别脾脏组织中相对分子质量(Mr)约为55 000的蛋白(抗原) (图3)。

  2.5 RAI16在再生肝组织中表达的Western blot分析 由于在酵母双杂交系统筛选中Tec酪氨酸激酶与RAI16蛋白相互作用的现象, Tec本身与肝癌细胞、 肝干细胞和肝细胞的关系密切, Tec是肝干细胞和肝细胞增殖、 定向诱导分化及凋亡信号转导途径中关键的蛋白激酶连接分子[1], Tec在肝再生过程中起着重要的调节作用[2]。因此, 将正常肝组织、 0.5 h、 1 h、 2 h、 4 h、 8 h、 24 h、 48 h、 72 h鼠再生肝组织分别裂解后获取的总蛋白作为电泳样本, 用制备的兔抗人RAI16合成肽的多克隆抗体为一抗, 以羊抗兔HRPIgG、 羊抗鼠HRPIgG为二抗, , 以小鼠抗βactin mAb作阴性对照, Western blot分析RAI16在再生肝组织中的表达。结果发现在从0.5 h到72 h鼠再生肝组织中, RAI16的表达于0.5 h即可检测到, 4 h达高峰(图4), 提示RAI16直接参与了肝细胞的增殖调控。

  2.6 RAI16多克隆抗体的免疫组化定位 RAI16蛋白是一种定位于胞质内内质网上的分泌型的球形信号蛋白[1]。经免疫组化实验证明, RAI16多肽多克隆抗体可与大鼠再生肝细胞胞质中的RAI16蛋白结合(图5) 。

  3 讨论

  随着人类基因组计划的完成, 蛋白质研究已成为后基因组时代的重要任务。抗体是研究蛋白质的必不可少的工具之一, 在一种新的cDNA被克隆后, 由此推译出的氨基酸序列人工合成多肽并与载体偶联, 免疫制备其抗体, 是一个快速而有效的手段[3]。抗原表位的选择是制备合成肽的关键。一般认为, 亲水性强和具有稳定构象的线性表位, 对于维持抗原的免疫反应性极其重要[4-7] 。我们通过综合分析RAI16的亲水性, 柔韧性, 抗原性及表面性4个参数预测的结果, 最终确定以亲水性强、 抗原指数高、 表面性及柔韧性好的区域(即44~55位的11个氨基酸)作为RAI16的抗原决定簇。但有些亲水肽段形成的抗原决定簇在变性条件下易受到破坏, 从而影响其抗体的特异性, 因此抗体纯化后需要对其进行全面鉴定[6]。由于RAI16在正常肝组织中表达较低, 而在脾脏、 结肠、 胎盘等组织中有明确的表达, 因此, 我们选择脾脏组织的蛋白作为电泳样本, 对纯化的兔抗人RAI16合成肽的多克隆抗体进行Western blot特异性分析, 结果发现兔抗人RAI16合成肽的多克隆抗体可特异性识别脾脏组织中Mr约为55 000的蛋白(抗原)。  鉴于RAI16最初作为Tec相互作用蛋白被筛选克隆得到, 提示Tec和RAI16蛋白之间存在相互作用。而Tec是国内外研究较活跃的一个非受体型蛋白酪氨酸激酶, 他主要介导细胞信号转导。已有研究表明Tec 基因是一种与肝再生调控密切相关的早期反应基因[2], 是肝干细胞和肝细胞增殖、 分化、 凋亡信号转导路径中关键的蛋白激酶连接分子。因此, 我们推测RAI16作为Tec激酶区作用蛋白, 可能与肝再生调控密切相关。我们利用新制备的抗RAI16合成肽多克隆抗体对其在再生肝组织中表达进行Western blot分析, 结果发现在从0.5 h到72 h鼠再生肝组织中, RAI16的表达于0.5 h即可检测到, 4 h达高峰, 提示RAI16具有调控肝细胞增殖的作用。经免疫组化实验证明, RAI16多肽多克隆抗体可与再生肝细胞胞质中的RAI16蛋白结合。此抗体的初步应用, 进一步表明我们所设计和合成的多肽是成功的。制备的高质量的抗RAI16合成多肽抗体效价高、 亲和力强、 特异性好, 能与天然RAI16发生反应, 可进一步用于免疫组化、 免疫沉淀和免疫印迹等实验、 以及其他体外实验分析。该合成肽及其抗体的制备, 为RAI16蛋白功能及作用机制的研究奠定了基础。

参考文献


[1] 王 阁, 邓 婧, 杨 进, 等. 视黄酸诱导蛋白16蛋白质结构功能分析[J]. 世界华人消化杂志, 2007, 15(12): 1342-1346.

[2] 王 阁, 冷恩仁, 胡 辂, 等. 肝细胞生成素及肝部分切除快速诱导肝再生相关基因Tec 的表达[J]. 中华消化杂志, 2002, 22(8): 455-458.

[3] Liu ZH, Li MY, Cui DF. A novel method for polypeptide design to prepare specific antibody of the peptide and applied to immunoassay[J]. J Immunol Methods, 2003, 281(1-2): 17-25.

[4] Merson RR, Franks DG, Karchner SI, et al. Development and characterization of polyclonal antibodies against the aryl hydrocarbon receptor protein family (AHR1, AHR2, and AHR repressor)[J]. Comp Biochem Physiol C Toxicol Pharmacol, 2006, 142(1-2): 85-94.

[5] Matsumoto K, Torimaru A, Ishitobi S. Preparation and characterization of a polyclonal antibody from rabbit for detection of trinitrotoluene by a surface plasmon resonance biosensor[J]. Talanta, 2005, 68(2): 305-311.

[6] Wang ST, Gui WJ, Guo YR, et al. Preparation of a multihapten antigen and broad specificity polyclonal antibodies for a multiple pesticide immunoassay[J]. Anal Chim Acta, 2007, 587(2): 287-292.

[7] Cao Z, Zhang J, Li Y, et al. Preparation of polyclonal antibody speciWc for AtPLC4, an Arabidopsis phosphatidylinositolspeciWc phospholipase C in rabbits[J]. Protein Expr Purif, 2007, 52(2): 306-312.

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