作者:刘芳 孙黎 杨翠军 李华 刘开扬
【摘要】 目的 探讨张家口地区健康人群CYP1A1基因MspI和Ile/Val的多态性。方法 采用等位基因特异性扩增和PCR限制性片段长度多态性(RFLP)技术,分析360例张家口地区健康成人的CYP1A1基因3′端限制性内切酶MspI位点和Exon7位点的3种基因型的分布规律。结果 张家口健康人群MspI基因型m1m1占35.8%,基因型m1m2占50.2%,基因型m2m2占14.0%,等位基因m1m2分别为60.9%,39.1%。Ile/Val多态性,其Ile及Val等位基因的频率分别为68.5%,31.5%。Ile/Ile,Ile/ Val,Val/Val基因型分布频率分别为44.4%,48.1%,7.5%。结论 张家口地区健康人群CYP1A1基因存在MspI和Ile/Val的多态性。
【关键词】 CYP1A1;MspI;Ile/Val;基因多态性
CYP1A1是细胞色素P(CYP)450家族的一名成员,是体内重要的Ⅰ相解毒酶之一,参与多种内外源性化学物质体内代谢过程〔1〕。CYP1A1由CYP1A1基因编码,CYP1A1表达受基因控制和环境因素诱导,并存在种族和个体差异。主要分布于肺、肾、胃肠道、皮肤、胎盘等组织中,参与内源性和外源性化合物在体内代谢过程,主要通过氧化、还原、水解等作用,改变化合物所具有的功能基团。或使其分解。CYP1A1主要参与多环芳烃类化合物(PAH)的代谢,把其代谢为酚类物质活性很强的环氧化物,这些环氧化物在致癌、致突变中都有重要作用〔2,3〕。目前为止,已发现CYP1A1基因MSPI和Ile/Val多态在不同的种族、民族和地区的分布有很大差异。本试验采用聚合酶链反应限制性片段长度多态性(PCRRFLP)的技术,探讨张家口地区健康人群CYP1A1基因的MspI和Ile/Val多态性分布。
1 材料与方法
1.1 研究对象
随机选择360例无血缘关系的健康张家口地区人员,均在原籍稳定居住2代以上,年龄18~55岁。经张家口河北北方学院第一附属医院门诊查体健康,无遗传疾病的健康人群。其中男性186例,女性174例。
1.2 标本收集
从上述人群中每人抽取外周静脉全血3 ml,EDTA抗凝,-80℃保存待测。
1.3 基因组DNA的制备
DNA提取试剂盒提取DNA。
1.4 PCR反应
1.4.1 MspI基因型测定
采用等位基因特异性扩增方法PCRRFLP技术,MspI基因型测定所需引物,其序列为上游5′CAGTGAAGAGGTGTAGCCGCT3′,下游5′TAGGAGTCTTGTCTCATGCCT3′。PCR的反应条件:反应总体积50 μl,含有200 μmol/L dNTP,上、下游引物各0.4 μmol/L,基因组DNA 0.4 μg,1 U TaqDNA聚合酶。在PCR仪上扩增,扩增参数:97℃预变性7 min,然后95℃,50 s,66℃复性50 s,72℃延伸1 min,30个循环后72℃延伸10 min。其PCR产物为340 bp的DNA片段。取10 μl PCR产物,加10 U MspI限制性内切酶,37℃水浴4 h,酶切产物经1.8%琼脂糖凝胶(含0.5 μg/ml溴化乙锭)电泳40 min,电压150 V,在紫外透射仪上观察结果。
1.4.2 Ile/Val多态性测定
采用等位基因特异性扩增方法PCRRFLP技术,分析Ile/Val多态性,引物序列:上游5CTGTCTCCCTCTGGTTACAGGAAGC3′,下游5′TTCCACCCGTTGCAGCAGGATAGCC3′。反应体系同上,扩增参数:95℃预变性5 min,然后95℃,30 s,63.5℃复性30 s,72℃延伸30 s,30个循环后72℃延伸7 min。其PCR产物为204 bp的DNA片段。取10 μl PCR产物,加10 U BsrD I限制性内切酶,25℃水浴24 h,酶切产物观察同上。
1.5 CYP1A1多态性
1.5.1 MspI基因型
扩增产物经酶切后分为3种基因型:没有MspI切割位点的等位基因m1的纯合子基因型m1m1(野生型),可见340 bp一个片段;有MspI切割位点的等位基因m2的纯合子基因型m2m2(突变型),可见200及140 bp 两个片段;m1和m2的杂合子基因型m1m2(杂合型),可见340,200,140 bp 三个片段。
1.5.2 Ile/Val多态性
扩增产物经酶切后分为3种基因型:没有切割位点为纯合子基因型Ile/Ile(野生型),可见204 bp一个片段;有BsrD I切割位点的等位基因Val/Val的纯合子基因型 (突变型),可见65及139 bp两个片段;Ile/ Val (杂合型),可见204,139,65 bp 三个片段。
1.6 统计学方法
采用SPSS软件分析,用χ2检验法比较基因多态性等位基因频率的差异,检验群体基因型频率分布是否符合HardyWeinberg平衡定律。x
【摘要】 目的 探讨张家口地区健康人群CYP1A1基因MspI和Ile/Val的多态性。方法 采用等位基因特异性扩增和PCR限制性片段长度多态性(RFLP)技术,分析360例张家口地区健康成人的CYP1A1基因3′端限制性内切酶MspI位点和Exon7位点的3种基因型的分布规律。结果 张家口健康人群MspI基因型m1m1占35.8%,基因型m1m2占50.2%,基因型m2m2占14.0%,等位基因m1m2分别为60.9%,39.1%。Ile/Val多态性,其Ile及Val等位基因的频率分别为68.5%,31.5%。Ile/Ile,Ile/ Val,Val/Val基因型分布频率分别为44.4%,48.1%,7.5%。结论 张家口地区健康人群CYP1A1基因存在MspI和Ile/Val的多态性。
【关键词】 CYP1A1;MspI;Ile/Val;基因多态性
CYP1A1是细胞色素P(CYP)450家族的一名成员,是体内重要的Ⅰ相解毒酶之一,参与多种内外源性化学物质体内代谢过程〔1〕。CYP1A1由CYP1A1基因编码,CYP1A1表达受基因控制和环境因素诱导,并存在种族和个体差异。主要分布于肺、肾、胃肠道、皮肤、胎盘等组织中,参与内源性和外源性化合物在体内代谢过程,主要通过氧化、还原、水解等作用,改变化合物所具有的功能基团。或使其分解。CYP1A1主要参与多环芳烃类化合物(PAH)的代谢,把其代谢为酚类物质活性很强的环氧化物,这些环氧化物在致癌、致突变中都有重要作用〔2,3〕。目前为止,已发现CYP1A1基因MSPI和Ile/Val多态在不同的种族、民族和地区的分布有很大差异。本试验采用聚合酶链反应限制性片段长度多态性(PCRRFLP)的技术,探讨张家口地区健康人群CYP1A1基因的MspI和Ile/Val多态性分布。
1 材料与方法
1.1 研究对象
随机选择360例无血缘关系的健康张家口地区人员,均在原籍稳定居住2代以上,年龄18~55岁。经张家口河北北方学院第一附属医院门诊查体健康,无遗传疾病的健康人群。其中男性186例,女性174例。
1.2 标本收集
从上述人群中每人抽取外周静脉全血3 ml,EDTA抗凝,-80℃保存待测。
1.3 基因组DNA的制备
DNA提取试剂盒提取DNA。
1.4 PCR反应
1.4.1 MspI基因型测定
采用等位基因特异性扩增方法PCRRFLP技术,MspI基因型测定所需引物,其序列为上游5′CAGTGAAGAGGTGTAGCCGCT3′,下游5′TAGGAGTCTTGTCTCATGCCT3′。PCR的反应条件:反应总体积50 μl,含有200 μmol/L dNTP,上、下游引物各0.4 μmol/L,基因组DNA 0.4 μg,1 U TaqDNA聚合酶。在PCR仪上扩增,扩增参数:97℃预变性7 min,然后95℃,50 s,66℃复性50 s,72℃延伸1 min,30个循环后72℃延伸10 min。其PCR产物为340 bp的DNA片段。取10 μl PCR产物,加10 U MspI限制性内切酶,37℃水浴4 h,酶切产物经1.8%琼脂糖凝胶(含0.5 μg/ml溴化乙锭)电泳40 min,电压150 V,在紫外透射仪上观察结果。
1.4.2 Ile/Val多态性测定
采用等位基因特异性扩增方法PCRRFLP技术,分析Ile/Val多态性,引物序列:上游5CTGTCTCCCTCTGGTTACAGGAAGC3′,下游5′TTCCACCCGTTGCAGCAGGATAGCC3′。反应体系同上,扩增参数:95℃预变性5 min,然后95℃,30 s,63.5℃复性30 s,72℃延伸30 s,30个循环后72℃延伸7 min。其PCR产物为204 bp的DNA片段。取10 μl PCR产物,加10 U BsrD I限制性内切酶,25℃水浴24 h,酶切产物观察同上。
1.5 CYP1A1多态性
1.5.1 MspI基因型
扩增产物经酶切后分为3种基因型:没有MspI切割位点的等位基因m1的纯合子基因型m1m1(野生型),可见340 bp一个片段;有MspI切割位点的等位基因m2的纯合子基因型m2m2(突变型),可见200及140 bp 两个片段;m1和m2的杂合子基因型m1m2(杂合型),可见340,200,140 bp 三个片段。
1.5.2 Ile/Val多态性
扩增产物经酶切后分为3种基因型:没有切割位点为纯合子基因型Ile/Ile(野生型),可见204 bp一个片段;有BsrD I切割位点的等位基因Val/Val的纯合子基因型 (突变型),可见65及139 bp两个片段;Ile/ Val (杂合型),可见204,139,65 bp 三个片段。
1.6 统计学方法
采用SPSS软件分析,用χ2检验法比较基因多态性等位基因频率的差异,检验群体基因型频率分布是否符合HardyWeinberg平衡定律。
2 结 果
2.1 CYP1A1基因MspI多态分布
张家口地区健康人群该基因多态位点m1及m2等位基因的频率分别为60.9%,39.1%。m1m1,m1m2,m2m2基因型分布频率分别为35.8%,50.2%,14.0%。经χ2检验基因型分布符合HardyWeinberg平衡定律(P>0.05)。
2.2 CYP1A1基因Ile/Val多态性
张家口地区健康人群该多态位点Ile及Val等位基因的频率分别为68.5%,31.5%。Ile/Ile,Ile/Val,Val/Val基因型分布频率分别为44.4%,48.1%,7.5%。经χ2检验基因型分布符合HardyWeinberg平衡定律(P>0.05)。
3 讨 论
CYP1A1是细胞色素P450家族的一名成员,是外源性和内源性化合物在体内代谢的重要Ⅰ相酶之一〔4,5〕。其参与PAH如苯并芘的代谢,将其氧化为酚类产物和环氧化物。CYP1A1基因位于人类第15对染色体,有7个外显子和6个内含子。目前研究发现,亚洲人群CYP1A1基因在其DNA结构的3′端非翻译区6235位点T→C突变形成MspI酶切位点,即CYP1A1基因MspI多态性,突变基因可影响CYP1A1的诱导性〔6〕,研究发现CYP1A1的T6235C位点突变不但增加了酶的活性,而且提高了酶的诱导性。同时,CYP1A1基因MspI多态分布具有明显的地区和种族差异。Ile/Val多态性是由于第七外显子4 889 kb位置上的AG突变,导致酶蛋白水平表现为亮氨酸变成缬氨酸,ValIle多态性可被限制性内切酶BsrD Ⅰ识别,研究发现携带Ile/Val,Val /Val的病人比Ile/Ile病人在某些肿瘤疾病中表现出更大的危险性。本研究发现张家口地区正常人群CYP1A1基因呈多态性分布,为进一步研究张家口地区CYP1A1基因多态性与肿瘤等疾病的关系奠定了基础。
参考文献
1 Miyoshi Y,Takahashi Y,Egawa C,et al.Breast cancer risk associated with CYP1A1 genetic polymorphisms in Japanese women〔J〕.Breast J,2002;8(4):20.
2 Hayashi SI,Watanabe J,Nakachi K,et al.Genetic linkage of lung cancerassociated MspⅠpolymorphisms with amino acid replacement in the hemebinding region of the human cytochrome P450 1A1 gene〔J〕.J Biochem,1991;110(3):407.
3 Belogubova EV,Ulibina YM,Suvorova IK,et al.Combined CYP1A1/GSTM1 at risk genotypes are overrepresented in squamous cell lung carcinoma patients but underrepresented in elderly tumorfree subjects〔J〕.J Cancer Res Clin Oncol,2006;132 (5):32731.
4 李佳圆,龙启明.有机氯农药、CYP1A1易感基因型与乳腺癌的相互作用研究〔J〕.现代预防医学,2008;35 (1):348.
5 Agundez JA.Cytochrome P450 gene polymorphism and cancer〔J〕.Curt Drug Metab,2004;5 (3):21124.
6 尹 琴,常福厚,王敏杰,等.蒙古族与汉族学生CYP1A1基因多态性比较〔J〕.中国公共卫生,2009;25(9):10534.